Alanya Üniversitesi için yasanın öngördüğü Üniversite Mütevelli Heyeti, Kurucu Vakıf tarafından 2009 yılında oluşturulmuş, 2010 yılında yeni eklenen üyelerle toplam üye sayısı 15 olarak belirlenmiştir. Kurucu mütevelli heyetin 4 Aralık 2010 tarihli toplantısında Üniversitenin fiziki, idari, mali ve idari yapılanması sürecindeki gelişmeler görüşülmüş ve Mütevelli Heyet kendi içinde bu konulara ilişkin çalışma grupları oluşturmuştur.
Alanya Üniversitesinin Ana Yönetmelik taslağı Kurucu Mütevelli Heyetinde görüşülerek kabul edilip, YÖK tarafından onanmış ve 18 Temmuz 2011 tarihli Resmi Gazete de yayınlanarak yürürlüğe girmiştir. Alanya Hamdullah Emin Paşa Üniversite adı; 09.02.2023 tarih ve 32099 sayılı Resmi Gazetede yayınlanan kararla birlikte ismi " ALANYA ÜNİVERSİTESİ" olmuştur.
